毛细管电色谱的双重分离机理可同时分离离子型和中性化合物。由于采用了电渗流驱动，因此不存在液相色谱中反压问题，因而，可以采用1.5μm超小粒径填料，柱效更高，峰形更好，峰容量更大；可以采用比液相色谱更长的色谱柱，获得更好的分离效果。电渗流的塞型流型改善了样品分子在色谱柱内的流型和分散，可获得远高于液相色谱的柱效。
我们为毛细管电色谱柱用户提供各种类型及粒径的填料，如C8，C18，苯基，氰基，硅胶，离子交换，手性填料等，粒径1.5μm — 5μm，并有不同内径及长度的柱管可以选择。内径为50、75、100、150、320μm，长度为20cm — 50cm。
毛细管色谱柱固定相及其应用范围
| 填料名称 | 键合官能团 | 性质 | 色谱分离方式 | 应用范围 |
C8 C18 | -C8H17 -C18H37 | 非极性 | 反相，离子对 | 中等极性化合物，溶于水的高极性化合物，如：小肽、蛋白质、甾族化合物（类固醇）、核碱，核苷、核苷酸、极性合成**等。 |
| 苯基 | -C6H5 | 非极性 | 反相，离子对 | 非极性**中等极性化合物，如脂肪酸，甘油脂、多核芳烃、酯类（邻苯二甲酸酯）、脂溶性维生素、甾族化合物（类固醇）、PTH衍生化氨基酸。 |
| 氨基 | -(CH2)3NH2 | 极性 | 正相，反相，阴离子交换 | 正相可分离极性化合物，如芳胺取代物，脂类，甾族化合物，氯代农药，反相分离单糖、双糖及多糖等碳水化合物；阴离子交换可分离酚、有机羧酸和核苷酸。 |
| 氰基 | -(CH2)3CN | 极性 | 正相，反相 | 正相相似于硅胶剂，为氢键接受体，适于分析极性化合物，溶质保留值比硅胶柱低，反相可提供与C8，C18，苯基柱不同的选择性。 |
| 强阳离子交换 | -(CH2)3C6H8SO3H- |
| 强阳离子交换 | 有机碱 |
| 强阴离子交换 | -(CH2)3N+(CH3) |
| 强阴离子交换 | 有机酸，核苷和核苷酸 |
| 硅胶 | -OH | 极性 | 正相 | 非极性，中等极性以及非离子性有机化合物 |
| 手性填料 |
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