为加强对水质采样的规范和指导，中国环境监测总站于2009年11月1日起正式实施《水质 采样技术指导》（HJ 494-2009）,该标准规定了质量保证控制、水质特征分析、底部沉积物及污泥的采样技术指导，适用于开阔河流、封闭管道、水库和湖泊、底部沉积物、地下水及污水采样。
根据采样类型的不同，采样过程将会使用不同的采样器及采样方式来进行。在主要修订的内容中，该标准对采样类型进行了补充，增加了封闭管道、水库和湖泊以及地下水采样内容。
开阔河流的采样
在对开阔河流进行采样时，不仅需要根据河流特点（如污水流入河流、支流合流等）决定采样点，同时各采样点原则上应在河流横向及垂向的不同位置采集样品。
水库和湖泊的采样
对于水库和湖泊的采样，由于采样地点不同和温度的分层现象可引起水质很大的差异。
在调查水质状况时，应考虑到成层期与循环期的水质明显不同。若需了解循环期水质，可采集表层水样；若需了解成层期水质，应按深度分层采样（浅层、中层及深层）。
在采集一定深度的水时，可用直立式或有机玻璃采水器。这类装置是在下沉的过程中，水就会从采样器中流过。当达到预定深度时，容器能够闭合而汲取水样。
