ABI 3100基因遗传分析仪以单束氩离子光照射在并排放置的16根毛细管上,毛细管的内外径及斜度都经过优化以减少因折射而产生的信号丢失。3100系统以双面照射的方式进一步提高信号的特异性。从毛细管中发出的荧光经光栅分光后,被CCD摄像机接收形成低杂波全光谱的数据。