实时荧光定量PCR仪百科知识
1. 定义与概述
实时荧光定量PCR仪(Real-Time Quantitative PCR, qPCR)是一种基于聚合酶链式反应(PCR)技术,通过荧光信号实时监测DNA扩增过程的高精度分子生物学仪器。
核心功能:
定量检测DNA/RNA的初始模板量(**定量或相对定量)。
检测基因表达水平、病原体载量、基因突变等。
广泛应用于疾病诊断、基因研究、食品**检测等领域。
2. 核心技术原理
荧光标记机制:
TaqMan探针法:探针带有荧光基团和淬灭基团,扩增时探针水解释放荧光。
SYBR Green法:染料嵌入双链DNA发出荧光,成本低但特异性稍差。
分子信标(Molecular Beacon):茎环结构探针,靶序列结合后发光。
检测模式:
终点法:仅检测**终产物量。
实时法:通过Ct值(阈值循环数)动态分析扩增曲线,实现精准定量。
3. 核心参数与性能指标
参数 | 意义 | 典型范围/要求 |
---|---|---|
检测通道数 | 支持多色荧光检测能力(如FAM, HEX, ROX) | 1-6通道(多用于多重PCR) |
灵敏度 | **低可检测DNA拷贝数 | 单拷贝(<10 copies/μL) |
温控精度 | 温度均一性和升降温速率 | ±0.1°C,升降温≥4°C/秒 |
动态范围 | 线性定量范围(Log值) | 7-8个数量级(10^1~10^8拷贝) |
4. 主要应用场景
**诊断:
病毒/**核酸检测(如新冠病毒、HPV、结核分枝杆菌)。
肿瘤基因突变检测(EGFR、KRAS等)。
科研领域:
基因表达分析(mRNA定量)。
miRNA检测、SNP分型。
农业与食品:
转基因成分鉴定。
食源性致病菌(如沙门氏菌)快速检测。
5. 与传统PCR的对比
特性 | 实时荧光定量PCR | 传统PCR |
---|---|---|
定量能力 | 实时监测,精准定量(基于Ct值) | 仅终点定性/半定量(电泳分析) |
检测速度 | 1-2小时(含数据分析) | 2小时+额外电泳时间 |
污染风险 | 闭管操作,污染风险低 | 开盖电泳,易污染 |
成本 | 较高(荧光试剂/探针) | 低 |
6. 操作流程与注意事项
标准流程:
样本制备:提取DNA/RNA并反转录为cDNA(RNA检测时)。
反应体系配制:加入引物、探针、模板、Taq酶等。
程序设置:设定扩增程序(预变性→循环扩增→熔解曲线分析)。
数据分析:通过软件计算Ct值,生成标准曲线或相对表达量。
关键注意事项:
避免RNA降解(使用RNase抑制剂)。
防止交叉污染(分区操作、UNG酶防残留)。
验证引物特异性(熔解曲线单峰)。
7. 主流品牌与型号
品牌 | 代表型号 | 特点 |
---|---|---|
Bio-Rad | CFX96 | 高性价比,5通道检测,适合中小型实验室 |
Thermo Fisher | QuantStudio 5 | 模块化设计,支持高通量(384孔板) |
Roche | LightCycler 480 | 超快升降温(19°C/秒),精准温控 |
Qiagen | Rotor-Gene Q | 离心式温控,均一性好,适合低浓度样本 |
8. 未来发展趋势
数字化PCR(dPCR):通过微滴分区实现**定量,无需标准曲线。
便携化设备:手持式qPCR仪(如BioFire FilmArray)用于床边检测。
AI整合:自动优化引物设计、智能分析扩增异常曲线。
多重检测升级:支持10+靶标同步检测(如病原体panel筛查)。
9. 常见问题(FAQ)
Q:是否**须做标准曲线?
A:**定量需要标准品绘制曲线;相对定量(如2^-ΔΔCt法)可不依赖标准曲线。Q:熔解曲线出现多峰怎么办?
A:可能为引物二聚体或非特异扩增,需优化引物浓度或退火温度。Q:如何提高低浓度样本的检测灵敏度?
A:增加模板体积、使用高灵敏度探针(如TaqMan MGB)、减少抑制剂干扰。
总结
实时荧光定量PCR仪凭借高灵敏度、快速定量、闭管防污染等优势,已成为分子诊断和基因研究的核心技术平台。随着数字化、微流控等技术的融合,其在精准医学和即时检测(POCT)中的应用将更加广泛。
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